O insucesso na terapia endodôntica pode ser resultado de várias falhas técnicas que impossibilitaram o controle e prevenção da infecção endodôntica. Remanescentes de polpa, tecido necrosado, bactérias e produtos bacterianos podem permanecer em áreas inacessíveis no interior do sistema de canais radiculares, resultando na permanência de uma infecção instalada na porção apical da raiz.

É importante salientar que o índice de sucesso nos retratamentos é menor que nos tratamentos primários, uma vez que o tratamento inicial pode ter alterado a anatomia original do canal, dificultando o alcance do limite de trabalho. Também as infecções secundárias são, na maioria das vezes, mais resistentes que as infecções primárias.